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  1. 浅谈组织离体时长对单细胞转录组测序的影响

1、浅谈组织离体时长对单细胞转录组测序的影响

因为组织可以直接从冻存状态开始抽核,此状态下细胞转录活动已经被抑制并固定,因此不会再发生转录状态改变,结果真实性提高。直接对细胞进行机械法或者化学法破碎,不会引入解离偏好性,理论上来讲所有细胞类型都能得到回收,能够获得更加完整和全面的细胞图谱。

高通量单细胞测序检测到3`端转录本,只有基因表达定量信息,无法得到基因结构变异信息;可以通过三代全长建库测序的方法解决可变剪切和融合基因的分析。

单细胞转录组测序 (Single Cell RNA Sequencing)是在单细胞水平对mRNA进行全转录组扩增及高通量测序的一种高端技术,研究单个细胞内的整体基因表达情况,以及基因的结构变异。主要用于细胞分子机制中细胞异质性研究、以及样本量少而无法进行常规高通量测序等。

近年来,单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)和空间转录组(ST)技术的出现加深了人们对细胞异质性、不同细胞类型的基因表达程序的理解。

这一技术流程包括捕获、标记、反转录、构建文库、测序,以及后续的详尽数据分析,每一个步骤都要求实验者对细胞数量、浓度和活性等参数有精确的把控。在医学领域,单细胞测序的应用举足轻重。

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